เจนิสเตอินถูกนำมาใช้ในหลายด้านทั้งทางการแพทย์และสุขภาพ เนื่องจากมีคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระและต้านการอักเสบ มักถูกใช้ในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารเพื่อช่วยลดความเสี่ยงของโรคหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ยังมีการศึกษาที่แสดงให้เห็นว่ามันอาจช่วยป้องกันมะเร็งบางชนิด เช่น มะเร็งเต้านมและมะเร็งต่อมลูกหมาก เนื่องจากมีฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งโดยรบกวนเส้นทางเอนไซม์ที่ส่งเสริมการพัฒนาของเนื้องอก

ในด้านความงาม เจนิสเตอินถูกนำมาใช้ในผลิตภัณฑ์บำรุงผิวเพื่อช่วยลดริ้วรอยและปรับสภาพผิวให้ดูอ่อนเยาว์ เนื่องจากช่วยกระตุ้นการผลิตคอลลาเจนและลดการทำลายเซลล์ผิวจากอนุมูลอิสระ นอกจากนี้ยังมีการวิจัยที่สนับสนุนการใช้เจนิสเตอินเพื่อช่วยบรรเทาอาการวัยทองในผู้หญิง เช่น ร้อนวูบวาบและอาการอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการลดลงของฮอร์โมนเอสโตรเจน รวมถึงการป้องกันการสูญเสียกระดูก

ในทางการเกษตร เจนิสเตอินถูกศึกษาเพื่อใช้เป็นสารกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืชและเพิ่มความต้านทานต่อโรคและแมลงศัตรูพืช เนื่องจากมีคุณสมบัติในการปรับปรุงระบบภูมิคุ้มกันของพืช