Penflufen ใช้ในการเกษตรเพื่อควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อรา โดยเฉพาะในพืชเช่น มันฝรั่ง ธัญพืช และพืชผักต่างๆ วิธีการใช้งานคือการเคลือบเมล็ดก่อนปลูก ซึ่งช่วยป้องกันการติดเชื้อราในระยะเริ่มต้นของพืช ทำให้พืชเจริญเติบโตได้ดีและมีผลผลิตเพิ่มขึ้น นอกจากนี้ยังมีประสิทธิภาพในการยับยั้งการแพร่กระจายของเชื้อราในดิน ช่วยลดความเสียหายที่อาจเกิดขึ้นกับพืชผล