ไซโปรโคนาโซลเป็นสารป้องกันและกำจัดเชื้อราที่ใช้อย่างแพร่หลายในภาคการเกษตรเพื่อควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อรา เช่น โรคราสนิม โรคราแป้ง และโรคใบจุด มันมีประสิทธิภาพสูงในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อราโดยการขัดขวางกระบวนการสังเคราะห์เออร์โกสเตอรอลซึ่งจำเป็นต่อการสร้างผนังเซลล์ของเชื้อรา สารนี้สามารถใช้กับพืชหลายชนิด เช่น ธัญพืช พืชผัก และไม้ผล โดยมักนำมาผสมในรูปแบบของสารละลายหรือสารแขวนลอยเพื่อฉีดพ่นบนใบพืช นอกจากนี้ ไซโปรโคนาโซลยังช่วยเพิ่มความทนทานของพืชต่อสภาวะแวดล้อมที่ไม่เอื้ออำนวย ทำให้พืชมีสุขภาพดีและให้ผลผลิตสูงขึ้น