เมทาฟลูมิโซนถูกใช้อย่างกว้างขวางเป็นยาฆ่าแมลงในภาคเกษตรกรรมเพื่อควบคุมศัตรูพืชหลากหลายชนิด โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ส่งผลกระทบต่อพืชผล เช่น ผัก ผลไม้ และฝ้าย มีประสิทธิภาพต่อตัวอ่อนของแมลงในกลุ่มเลปิโดปเทรา เช่น หนอนผีเสื้อ และศัตรูพืชในกลุ่มโคเลโอปเทรา เช่น ด้วง ซึ่งสามารถก่อให้เกิดความเสียหายอย่างมีนัยสำคัญต่อพืช สารเคมีนี้ทำงานโดยการรบกวนช่องไอออนโซเดียมในระบบประสาทของแมลง นำไปสู่การเป็นอัมพาตและในที่สุดคือความตาย การใช้งานของเมทาฟลูมิโซนมักได้รับความนิยมเนื่องจากความเป็นพิษแบบเลือกสรร ซึ่งกำหนดเป้าหมายไปที่ศัตรูพืชในขณะที่ลดความเป็นอันตรายต่อแมลงที่มีประโยชน์ เช่น ตัวผสมเกสร เมื่อใช้อย่างถูกต้อง นอกจากนี้ เมทาฟลูมิโซนยังถูกรวมไว้ในโปรแกรมการจัดการศัตรูพืชแบบบูรณาการ (IPM) เพื่อลดการพึ่งพาสารเคมีที่เป็นพิษมากกว่าและจัดการการพัฒนาการดื้อยาของประชากรศัตรูพืช ถูกนำไปใช้ผ่านการฉีดพ่นทางใบ เพื่อให้แน่ใจถึงการครอบคลุมทั่วถึงของพื้นผิวพืชเพื่อประสิทธิภาพสูงสุด