ใช้เมธอกซีเฟโนไซด์เป็นสารกำจัดแมลงชนิดหนึ่งที่มีประสิทธิภาพสูงในการควบคุมหนอนศัตรูพืช โดยเฉพาะในกลุ่มหนอนผีเสื้อ เช่น หนอนเจาะสมอข้าว หนอนเจาะลำต้นข้าวโพด และหนอนกระทงผัก สารนี้ทำงานโดยเลียนแบบฮอร์โมนลอกคราบของแมลง ทำให้แมลงเกิดการลอกคราบผิดปกติและตายในที่สุด เมธอกซีเฟโนไซด์มีความเป็นพิษต่ำต่อสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมและสิ่งแวดล้อม รวมถึงมีความปลอดภัยต่อแมลงศัตรูพืชที่มีประโยชน์ เช่น แตนเบียนและผึ้ง จึงเหมาะสำหรับใช้ในระบบการจัดการศัตรูพืชแบบผสมผสาน (IPM) นิยมใช้ในพืชเศรษฐกิจหลายชนิด เช่น ข้าว ข้าวโพด ผัก ผลไม้ และพืชไร่ โดยสามารถพ่นทางใบและมีฤทธิ์ได้ทั้งแบบสัมผัสและรับประทาน ช่วยลดความเสียหายจากแมลงและเพิ่มผลผลิตทางการเกษตรได้อย่างมีประสิทธิภาพ