สารฟลูริดอนใช้เป็นสารกำจัดวัชพืชชนิดหนึ่ง โดยเฉพาะพืชน้ำที่เป็นปัญหา เช่น ต้นบัว ต้นผักตบชวา และพืชน้ำรุกรานอื่น ๆ ที่เติบโตในแหล่งน้ำจืด สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการสังเคราะห์คลอโรฟิลล์ในพืช ทำให้พืชไม่สามารถสังเคราะห์แสงได้ ส่งผลให้พืชค่อย ๆ เหี่ยวและตายลง นิยมใช้ในแหล่งน้ำขนาดใหญ่ เช่น บึง คลอง หรืออ่างเก็บน้ำ ซึ่งการควบคุมพืชน้ำด้วยวิธีกลหรือการใช้มือเก็บอาจทำได้ยาก ฟลูริดอนมีประสิทธิภาพในการควบคุมพืชน้ำในระยะยาว และมีความเป็นพิษต่ำต่อสัตว์น้ำ เช่น ปลา เมื่อใช้ในอัตราที่เหมาะสม อย่างไรก็ตาม ควรใช้อย่างระมัดระวังเพื่อหลีกเลี่ยงผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและพืชชนิดอื่นที่ไม่ต้องการกำจัด