เบนัลแลกซิลในเมทานอลใช้เป็นสารกำจัดเชื้อราในภาคการเกษตร โดยเฉพาะในการควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อราในกลุ่มโออมัยซีต (Oomycetes) เช่น เชื้อรา Phytophthora และ Pythium ซึ่งเป็นสาเหตุของโรคเน่าราก รากเน่า และโรคใบไหม้ในพืชหลายชนิด เช่น มันฝรั่ง มะเขือเทศ แตงกวา และองุ่น สารนี้มีฤทธิ์ออกฤทธิ์แบบระบบซึมซับ คือสามารถถูกดูดซึมเข้าสู่เนื้อเยื่อของพืชได้เร็ว ช่วยป้องกันและรักษากลุ่มเชื้อราที่ติดเชื้อภายในเนื้อเยื่อพืชได้อย่างมีประสิทธิภาพ นิยมใช้โดยการพ่นทางใบหรือราดที่โคนต้น ขึ้นอยู่กับชนิดของพืชและลักษณะการระบาดของโรค เบนัลแลกซิลในเมทานอลมักใช้ในรูปของสารละลายเข้มข้นที่เจือจางก่อนใช้งาน และมีความเสถียรในสภาวะปกติ ทำให้เหมาะสำหรับการเก็บรักษาและการใช้งานในสนามจริง