เบนาแลกซิลใช้เป็นสารกำจัดเชื้อราในพืช ซึ่งมีประสิทธิภาพต่อเชื้อราในกลุ่ม Oomycetes โดยเฉพาะเชื้อราที่ก่อให้เกิดโรคเน่าดำ เน่าราก และโรคใบจุดในพืชหลายชนิด เช่น มันฝรั่ง มะเขือเทศ องุ่น และผักต่างๆ นิยมใช้ในรูปของสารละลายเพื่อฉีดพ่นทางใบหรือผสมกับดินก่อนปลูก ช่วยป้องกันการติดเชื้อในระยะเริ่มต้นและยับยั้งการแพร่กระจายของเชื้อราในพืช ใช้ได้ทั้งในพื้นที่เปิดและเรือนเพาะปลูก เบนาแลกซิลออกฤทธิ์โดยการรบกวนการสังเคราะห์ RNA ของเชื้อรา ทำให้เชื้อไม่สามารถเจริญเติบโตและแพร่พันธุ์ได้ จึงช่วยลดความเสียหายของผลผลิตและเพิ่มผลผลิตทางการเกษตร ควรใช้ร่วมกับมาตรการควบคุมโรคอื่นๆ และสลับกับสารกำจัดเชื้อราชนิดอื่นเพื่อลดความเสี่ยงในการเกิดความต้านทานของเชื้อรา