ใช้สารแอซอกซีสโทรบินเป็นสารกำจัดเชื้อราในพืชเกษตร โดยมีประสิทธิภาพสูงในการควบคุมโรคที่เกิดจากเชื้อราหลายชนิด เช่น โรคใบไหม้ โรคขอบใบแห้ง และโรคเน่าดำ โดยเฉพาะในพืชเศรษฐกิจสำคัญ เช่น ข้าว ยางพารา มันสำปะหลัง ข้าวโพด และพืชผักต่างๆ แอซอกซีสโทรบินทำงานโดยการยับยั้งการหายใจของเชื้อราที่ผนังเซลล์ ทำให้เชื้อราไม่สามารถผลิตพลังงานได้ ส่งผลให้เจริญเติบโตไม่ได้และตายลง สารนี้มีคุณสมบัติเคลื่อนที่ภายในพืชได้ดี จึงช่วยป้องกันและรักษาระยะเริ่มต้นของการติดเชื้อได้อย่างมีประสิทธิภาพ นิยมใช้ในรูปแบบของสารละลายฉีดพ่นทางใบ สามารถใช้ร่วมกับสารกำจัดศัตรูพืชชนิดอื่นได้เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพ แต่ควรหลีกเลี่ยงการใช้ต่อเนื่องนานเกินไปเพื่อลดความเสี่ยงที่เชื้อราจะดื้อยา