สารแอซอกซีสตรอบินเป็นสารกำจัดเชื้อราที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในภาคการเกษตร โดยมีประสิทธิภาพในการควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อราหลายชนิด เช่น ราสนิม ราดำ และโรคใบไหม้ โดยทำงานยับยั้งการหายใจของเชื้อรา ทำให้เชื้อราไม่สามารถผลิตพลังงานได้ จึงตายลง นิยมใช้พ่นหรือราดในพืชเศรษฐกิจหลายชนิด เช่น ข้าว ยางพารา มันสำปะหลัง ข้าวโพด และพืชผักต่าง ๆ เพื่อป้องกันและรักษาโรคในช่วงที่พืชเริ่มแสดงอาการหรือก่อนที่โรคจะระบาด โดยเฉพาะในช่วงฤดูฝนที่มีความชื้นสูง ซึ่งเอื้อต่อการเจริญเติบโตของเชื้อรา สารนี้มีคุณสมบัติเคลื่อนที่ภายในพืชได้บางส่วน จึงช่วยป้องกันส่วนที่ยังไม่ติดเชื้อได้ดี และมีฤทธิ์ต้านเชื้อราได้ทั้งแบบป้องกันและรักษา ทำให้เกษตรกรนิยมใช้ในระบบการจัดการศัตรูพืชแบบผสมผสาน (IPM) เพื่อลดการดื้อยาของเชื้อรา อย่างไรก็ตาม ควรใช้ตามอัตราที่แนะนำและหมุนเวียนกับสารกำจัดเชื้อราชนิดอื่น เพื่อลดความเสี่ยงในการเกิดการดื้อยา และต้องปฏิบัติตามช่วงเวลารอหลังการเก็บเกี่ยว (Pre-harvest interval) เพื่อความปลอดภัยต่อผู้บริโภค