N-Z-Ethylenediamine hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีวเคมีในฐานะรีเอเจนต์สำหรับการปรับเปลี่ยนโปรตีนและเปปไทด์ โดยมีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยาการเชื่อมขวาง (cross-linking) ซึ่งช่วยในการทำให้โครงสร้างโปรตีนคงตัวหรือสร้างปฏิกิริยาโมเลกุลเฉพาะเจาะจง สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการเตรียมยาและสารประกอบชีวภาพ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวบัฟเฟอร์ในงานทดลองชีวเคมีต่างๆ เพื่อรักษาความคงที่ของ pH ระหว่างการทดลอง การประยุกต์ใช้ของสารนี้ยังขยายไปสู่สาขาเคมีโพลิเมอร์ ซึ่งถูกนำมาใช้ในการผลิตเรซินและสารเคลือบพิเศษ