สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์และเปปไทโดมิมิติกส์ โดยทำหน้าที่เป็นอินเทอร์มีเดียตที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งกลุ่มเทอร์ต-บูทอกซี่คาร์บอนิล (Boc) ช่วยปกป้องฟังก์ชันเอมีนระหว่างปฏิกิริยาเคมี ทำให้สามารถปรับแต่งส่วนอื่นของโมเลกุลได้อย่างเลือกสรร แหวนไซโคลเพนเทนให้ความแข็งแรงทางโครงสร้าง ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบเปปไทด์ที่มีคอนฟอร์เมชันถูกจำกัด ซึ่งมักถูกสำรวจในการค้นพบยาเนื่องจากมีประสิทธิภาพการจับที่เพิ่มขึ้นและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีกว่า นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพและเป็นหน่วยย่อยในการเคมียารักษาเพื่อสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ทางรักษา