Fmoc-Glu(OtBu)-H ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกรดกลูตามิก กลุ่ม Fmoc ช่วยปกป้องกลุ่มอะมิโนระหว่างกระบวนการคัปปลิ้ง ในขณะที่กลุ่ม OtBu ปกป้องสายโซ่ข้างของกรดคาร์บอกซิลิก สิ่งนี้ช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกันแบบเลือกสรรและสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนได้ ใช้บ่อยครั้งในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) เพื่อผลิตเปปไทด์ที่มีความบริสุทธิ์และความจำเพาะสูง ความเสถียรภายใต้สภาวะเบสทำให้เหมาะสมสำหรับการประกอบเปปไทด์แบบขั้นตอน ใช้อย่างกว้างขวางในงานวิจัยเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาเปปไทด์บำบัดและยาที่มีพื้นฐานจากโปรตีน ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและกิจกรรมของเอนไซม์ ความหลากหลายและความน่าเชื่อถือทำให้เป็นสารหลักในห้องปฏิบัติการเคมีอินทรีย์และเคมีทางการแพทย์