สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารเคมีเฉพาะทางสำหรับศึกษากิจกรรมของเอนไซม์และปฏิกิริยาระหว่างโปรตีน โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่มปกป้องเบนซิโลกซิคาร์บอนิล (benzyloxycarbonyl) และส่วนไดไนโตรฟีนิล (dinitrophenyl) ทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และเป็นสารตั้งต้น (substrate) สำหรับเอนไซม์โปรตีโอลิติก นักวิจัยใช้สารนี้ในการตรวจสอบความจำเพาะและจลนศาสตร์ของเอนไซม์ เช่น โปรติเอส (proteases) ซึ่งมีความสำคัญต่อการทำความเข้าใจกระบวนการในเซลล์และการพัฒนายารักษา นอกจากนี้ การออกแบบที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยในการตรวจจับและวัดปริมาณกิจกรรมของเอนไซม์ผ่านวิธีสเปกโตรโฟโตเมทรี โดยอาศัยคุณสมบัติการดูดกลืนแสงที่แตกต่างของกลุ่มไดไนโตรฟีนิล สารเคมีนี้ยังมีคุณค่าในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์ สนับสนุนการค้นพบยาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางเอนไซม์เฉพาะในโรค เช่น มะเร็งและโรคอักเสบ