สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ กลุ่มฟังก์ชัน Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่กลุ่มเบนзиล (benzyl) ปกป้องหมู่ไฮดรอกซิลของโฮโมซีรีน การใช้สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ และสามารถกำจัดกลุ่มป้องกันได้ง่ายในขั้นตอนสุดท้ายของการสังเคราะห์ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีและชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกและหน้าที่ของโปรตีนและเปปไทด์ในระบบชีวภาพ