N-Fmoc-(S)-4-fluorohomophenylalanine ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) กลุ่มป้องกัน Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) มีบทบาทสำคัญในการปกป้องกลุ่มอะมิโนชั่วคราวระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ ช่วยให้สามารถถอดป้องกันแบบเลือกสรรและยืดโซ่เปปไทด์ได้ การรวมส่วน (S)-4-fluorohomophenylalanine นำเสนอโซ่ข้างอะโรมาติกที่ถูกฟลูออรีนแทนที่ ซึ่งสามารถเพิ่มความเสถียร การจับคู่แบบจำเพาะ และความต้านทานต่อการเผาผลาญของเปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายา 기반เปปไทด์ เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์ ตัวกระตุ้น/ยับยั้งตัวรับ และตัวแทนวินิจฉัย นอกจากนี้ อะตอมฟลูออรีนยังสามารถใช้ในการศึกษากโครงสร้าง เช่น NMR spectroscopy เพื่อให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการกำหนดรูปแบบเปปไทด์และปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุล การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยในเคมียารักษาโรค ซึ่งกรดอะมิโนฟลูออรีนถูกสำรวจเพื่อศักยภาพในการปรับปรุงคุณสมบัติคล้ายยา