Fmoc-3-methoxy-L-homophenylalanine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับฟังก์ชันอะมิโน ซึ่งช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์แบบต่อเนื่องด้วยความแม่นยำและประสิทธิภาพสูง กลุ่ม 3-methoxy บนโซ่ข้างของ homophenylalanine สามารถมีอิทธิพลต่อการกำหนดรูปร่างและคุณสมบัติการจับของเปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง มันถูกนำมาใช้อย่างทั่วไปในการพัฒนายาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ ตัวยับยั้งเอนไซม์ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีน-โปรตีน ความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอล SPPS มาตรฐานทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนทั้งในสถานศึกษาและอุตสาหกรรม