Fmoc-2,5-difluoro-L-homophenylalanine เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ Solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่สำคัญในการสร้างเปปไทด์และโปรตีนในห้องปฏิบัติการ เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ที่ติดอยู่กับโมเลกุลนี้ช่วยในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโนระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ การที่มีฟลูออรีนสองอะตอมในโครงสร้างของสารนี้ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและความจำเพาะของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ขึ้น ทำให้เหมาะสำหรับการวิจัยทางเภสัชวิทยาและการพัฒนายา โดยเฉพาะในด้านการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือสารต้านจุลชีพ สารนี้ยังสามารถใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์กับโปรตีนเป้าหมาย ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการพัฒนายาและวัคซีนใหม่ ๆ ด้วยคุณสมบัติเหล่านี้ Fmoc-2,5-difluoro-L-homophenylalanine จึงเป็นสารที่มีบทบาทสำคัญในวงการชีวเคมีและเภสัชวิทยา