สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการสร้างเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ กลุ่มฟังก์ชัน Fmoc (9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl) ในโมเลกุลทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถูกกำจัดออกได้อย่างง่ายดายโดยใช้เบส เช่น ไพเปอริดีน ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ กลุ่มไซยาโน (-CN) และกลุ่มเบนซิลเอสเทอร์ (-COOCH2C6H5) ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและควบคุมทิศทางของปฏิกิริยา ทำให้สารนี้มีประโยชน์ในการสร้างโมเลกุลเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนและมีความเฉพาะเจาะจงสูง