สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันสำหรับกลุ่มฟังก์ชันอะมิโน ซึ่งช่วยให้สามารถยกเลิกการป้องกันอย่างเลือกเฉพาะได้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ส่วนของ bromopyridinyl สามารถทำหน้าที่เป็นจุดยึดปฏิกิริยา (reactive handle) สำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมหรือการคอนจูเกต (conjugation) ทำให้มีคุณค่าสำหรับการพัฒนายา 기반เปปไทด์ สารไบโอคอนจูเกต หรือโปรบ การประยุกต์ใช้สารนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในเคมียา (medicinal chemistry) และการวิจัยทางชีวเคมี ซึ่งต้องการการควบคุมลำดับเปปไทด์และการดัดแปลงอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ อะตอมโบรมีนยังอำนวยความสะดวกในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง (cross-coupling reactions) เพื่อนำกลุ่มเคมีที่หลากหลายมาใช้ในการปรับโครงสร้างขั้นสูง