Fmoc-Agp(Boc)2-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมในการสร้างเปปไทด์ในห้องปฏิบัติการ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Boc (tert-butyloxycarbonyl) ปกป้องหมู่ข้างเคียงของกรดอะมิโน arginine สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ และง่ายต่อการกำจัดกลุ่มป้องกันเมื่อสิ้นสุดกระบวนการ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลใหม่ๆ