สารนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการเตรียมเปปไทด์และเปปไทด์มิมิติกที่ซับซ้อน การป้องกันแบบคู่ด้วยกลุ่ม Boc และ Fmoc บนไนโตรเจนทั้งสองของวงแหวนไพเพอราซีนช่วยให้สามารถยกเลิกการป้องกันแบบเลือกเฉพาะได้ สนับสนุนการสร้างโซ่เปปไทด์แบบขั้นตอน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์บนเฟสแข็ง (SPPS) โดยช่วยในการนำหมู่ไพเพอราซีนเข้าไปในโครงสร้างเปปไทด์ ซึ่งสามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือความเสถียรของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ยาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคติดเชื้อ ความหลากหลายทำให้เป็นสารเคมีที่เป็นประโยชน์ในเคมียารักษาและการค้นพบยา