สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่อะมิโนหลัก ในขณะที่กลุ่ม benzyloxycarbonyl (Z) ป้องกันหมู่เอมีนของสายข้าง กลยุทธ์การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกสรรได้ในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนได้ทีละขั้นตอน การประยุกต์ใช้สารนี้มีความสำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาทางชีวเคมี เพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์เปปไทด์ที่มีความบริสุทธิ์สูงและความจำเพาะเจาะจง