ใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งกลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ปกป้องส่วน amine หลัก และกลุ่ม Alloc (allyloxycarbonyl) ปกป้อง amine ในสายข้าง การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกได้ในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน ทำให้สามารถประกอบเปปไทด์แบบทีละขั้นตอนได้ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะหรือการปรับเปลี่ยนสำหรับการวิจัยในชีวเคมี การพัฒนายา และการประยุกต์ใช้ทางบำบัด โครงสร้างแบบสเตอรีโอของมันยังช่วยให้มั่นใจถึงการจัดเรียงเชิงพื้นที่ที่ถูกต้องของโซ่เปปไทด์ ซึ่งสำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพ