ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมออกซิมและอะไมด์ ทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไฟล์ในการทำปฏิกิริยากับสารประกอบคาร์บอนิล ทำให้เกิดอนุพันธ์ไฮดรอกซิลามีนที่ถูกอัลไคไลต์ที่ไนโตรเจน นิยมใช้ในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรมที่ต้องการการนำไนโตรเจนเข้าไปอย่างเลือกสรร นอกจากนี้ยังใช้ในการปรับโครงสร้างเปปไทด์และโปรตีนสำหรับการศึกษาไบโอเคมี รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและความละลายในตัวกลางปฏิกิริยาน้ำ