สารละลายคลอรามีน T ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและสารต้านจุลินทรีย์ในหลายสาขา มีประสิทธิภาพในการบำบัดน้ำ โดยเฉพาะการฆ่าเชื้อน้ำดื่มและสระว่ายน้ำ เนื่องจากสามารถปล่อยคลอรีนออกมาอย่างค่อยเป็นค่อยไปและควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์

ในสถานพยาบาล ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อเฉพาะที่สำหรับทำความสะอาดแผลและฆ่าเชื้อผิวหนัง โดยเฉพาะในสัตวแพทย์และหัตถการผ่าตัดเล็ก ฤทธิ์อ่อนโยนทำให้เหมาะสำหรับเนื้อเยื่อที่บอบบาง

สารละลายนี้ยังใช้ในงานห้องปฏิบัติการ เช่น สารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์และการออกซิเดชันของซัลไฟด์และอะมีน นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมอาหารสำหรับฆ่าเชื้ออุปกรณ์และพื้นผิว เพื่อความสะอาดโดยไม่ทิ้งสารตกค้างที่เป็นอันตราย

เนื่องจากความเสถียรและการปล่อยคลอรีนที่ออกฤทธิ์แบบควบคุม คลอรามีน T จึงได้รับความนิยมมากกว่ากลุ่มคลอรีนที่ระเหยง่ายในงานที่ต้องการฤทธิ์ต้านจุลินทรีย์ยาวนาน แต่ควรใช้ในความเข้มข้นที่เหมาะสมเพื่อหลีกเลี่ยงการกัดกร่อนหรือตกค้างที่อาจเป็นอันตระ