สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารเคมีอันหลากหลายสำหรับการนำเข้าชนิดกลุ่มไอโอโดเมทิล (iodomethyl group) สิ่งนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง โดยทำหน้าที่เป็นแหล่งที่เสถียรและมีประสิทธิภาพของส่วนโมเลกุลไอโอโดเมทิล กลุ่มไตรฟลูออโรบอเรตช่วยเสริมความเสถียร ทำให้จัดการและเก็บรักษาได้ง่ายกว่าเมื่อเทียบกับสารไอโอโดเมทิลอื่นๆ สารนี้ถูกนำมาใช้บ่อยในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร ซึ่งต้องการการแปลงกลุ่มฟังก์ชันอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ความตอบสนองของมันยังช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนและคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในเคมียารักษาและวิทยาศาสตร์วัสดุ