เมทิลทินไตรคลอไรด์ ใช้เป็นสารกลางหลักในการผลิตสารออร์กาโนทิน ซึ่งมีแอปพลิเคชันอุตสาหกรรมหลากหลาย มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สาร стабилизатор สำหรับพลาสติกโพลีไวนิลคลอไรด์ (PVC) เพื่อเพิ่มความเสถียรทางความร้อนและความทนทาน นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการผลิตตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับปฏิกิริยาเคมี โดยเฉพาะในการผลิตโพลียูรีเทนและซิลิโคน การใช้งานยังขยายไปถึงการสร้างสารป้องกันการยึดเกาะในสีทาสีเรือ ซึ่งป้องกันการเจริญเติบโตของสิ่งมีชีวิตบนตัวเรือ