ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาตั้งต้น (intermediate) ในการสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิก โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารที่มีหมู่อะมิโนหรือหมู่ไฮดรอกซิลได้ง่าย ทำให้สามารถสร้างซัลโฟนามายด์หรือซัลเฟตเอสเทอร์ได้ โครงสร้างที่มีฟลูออรีนและไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมัน (lipophilicity) และเพิ่มความเสถียรของโมเลกุล ซึ่งเป็นคุณสมบัติที่ต้องการในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ จึงนิยมใช้ในขั้นตอนการพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะยาที่ต้องการข้ามเยื่อหุ้มเซลล์หรือระบบประสาทส่วนกลาง