ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยา โดยเฉพาะยาที่มีโครงสร้างเป็นสารอินทรีย์ที่มีฟลูออรีน ซึ่งช่วยเพิ่มความสามารถในการดูดซึมของยาและเพิ่มความจำเพาะต่อเป้าหมายในร่างกาย นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น ๆ เนื่องจากหมู่ฟลูออรีนและไตรฟลูออร์เมทิลช่วยปรับปรุงเสถียรภาพของโมเลกุลและลดการสลายตัวในระบบเมตาบอลิซึม