ไอโซไพลโอคาร์พีน ไนเตรท ใช้หลักๆ ในจักษุวิทยาเป็นยาที่ทำให้ม่านตาหดตัว (miotic agent) เพื่อหดม่านตาและลดความดันภายในลูกตา ใช้บ่อยในการรักษาโรคต้อหิน โดยช่วยจัดการภาวะนี้ด้วยการอำนวยความสะดวกในการระบายน้ำหล่อเลี้ยงในตา (aqueous humor) นอกจากนี้ยังใช้ในขั้นตอนการวินิจฉัยบางอย่างเพื่อกระตุ้นการหดตัวของม่านตา (miosis) สำหรับการตรวจตาโดยละเอียด สารนี้ยังอาจใช้ในการจัดการภาวะเช่น accommodative esotropia ซึ่งช่วยปรับปรุงการจัดแนวการมองเห็น ผลทางรักษาของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าทั้งในสถานการณ์ทางคลินิกและการวินิจฉัยที่เกี่ยวข้องกับสุขภาพตา