เบอร์เบอรีน คลอไรด์ ไฮเดรต ถูกใช้กันอย่างแพร่หลายในด้านสุขภาพและทางการแพทย์ โดยเฉพาะในสมุนไพรจีนดั้งเดิม สารนี้มีคุณสมบัติช่วยควบคุมระดับน้ำตาลในเลือด จึงนิยมใช้ในผู้ที่มีภาวะน้ำตาลในเลือดสูงหรือโรคเบาหวานชนิดที่ 2 ช่วยเพิ่มความไวต่ออินซูลินและลดการสร้างน้ำตาลในตับ นอกจากนี้ยังมีฤทธิ์ช่วยลดระดับคอเลสเตอรอลและไตรกลีเซอไรด์ในเลือด ทำให้เหมาะสำหรับผู้ที่มีปัญหาไขมันในเลือดสูง อีกทั้งยังมีคุณสมบัติต้านการอักเสบ ต้านจุลชีพ และต้านออกซิเดชัน จึงถูกใช้ในการรักษาอาการติดเชื้อในระบบทางเดินอาหาร เช่น ท้องร่วงจากแบคทีเรีย ในด้านการดูแลสุขภาพทั่วไป เบอร์เบอรีนยังช่วยในการควบคุมน้ำหนัก โดยการปรับสมดุลไมโครไบโอตาในลำไส้ และช่วยลดการดูดซึมน้ำตาลและไขมันจากอาหาร ทำให้เป็นที่นิยมในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารเพื่อสุขภาพลำไส้และการลดน้ำหนัก