Guanosine 5'-phosphate disodium salt hydrate ใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลและชีวเคมีเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์ RNA และ DNA มีบทบาทสำคัญในการศึกษาการเมตาบอลิซึมนิวคลีโอไทด์ จลนศาสตร์เอนไซม์ และเส้นทางสัญญาณเซลล์ ในอุตสาหกรรมอาหาร ใช้เป็นสารเพิ่มรสชาติ โดยมักรวมกับนิวคลีโอไทด์อื่นๆ เพื่อเพิ่มรสอูมามิในอาหารแปรรูป นอกจากนี้ ใช้ในการผลิตยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยารักษามะเร็ง เนื่องจากเกี่ยวข้องกับการบำบัดด้วยนิวคลีโอไทด์ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปยังการทดสอบวินิจฉัย ที่ช่วยในการตรวจจับและวัดปริมาณกรดนิวคลีอิก