α,β-Methyleneadenosine 5′-diphosphate sodium salt ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ โดยเฉพาะเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์และเมแทบอลิซึมของนิวคลีโอไทด์ เนื่องจากโครงสร้างคล้ายกับสารตั้งต้นตามธรรมชาติ จึงสามารถยับยั้งหรือปรับเปลี่ยนกิจกรรมของเอนไซม์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของกระบวนการเมแทบอลิซึม เช่น โรคมะเร็งและโรคติดเชื้อ โดยมุ่งเน้นการออกแบบสารยับยั้งที่จำเพาะเจาะจงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ