N6-Benzoyl-2'-deoxyadenosine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ oligonucleotides โดยเฉพาะในสาขาวิทยาศาสตร์ชีวโมเลกุลและการวิจัยทางพันธุกรรม มันทำหน้าที่เป็น nucleoside กลางที่ได้รับการป้องกัน เพื่อให้มั่นใจในการปรับเปลี่ยนเบสอะดีนีนอย่างเลือกสรรระหว่างการสร้างลำดับ DNA สารเคมีนี้มีความสำคัญในเครื่องสังเคราะห์ DNA อัตโนมัติ ซึ่งช่วยในการประกอบสาย DNA แบบกำหนดเองทีละขั้นตอนสำหรับการประยุกต์ใช้ เช่น PCR การโคลนยีน และการจัดลำดับดีเอ็นเอ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนา antisense oligonucleotides และกรดนิวคลีอิกบำบัดอื่นๆ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาการแพทย์เฉพาะบุคคลและการบำบัดยีนแบบกำหนดเป้าหมาย ความเสถียรและความเข้ากันได้กับเคมี phosphoramidite ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการผลิต DNA ความบริสุทธิ์สูงสำหรับทั้งการวิจัยและวัตถุประสงค์ทางคลินิก