ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ผ่านเคมีฟอสโฟราไมดิทแบบเฟสของแข็ง บทบาทหลักคือการป้องกันหมู่ไฮดรอกซิล 3′ และ 5′ ของไทมิดีนระหว่างการสังเคราะห์ดีเอ็นเอ ซึ่งช่วยให้สามารถคัปปลิงแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งที่ต้องการได้ กลุ่มเทอร์ต-บิวทิลไดเมทิลซิลิล (TBDMS) มีความเสถียรภายใต้สภาวะกรดและเบส แต่สามารถถูกกำจัดแบบเลือกสรรโดยใช้ไอออนฟลูออไรด์ ทำให้เหมาะสมสำหรับการประกอบสายดีเอ็นเอแบบทีละขั้นตอน สารประกอบนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในการผลิตโอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบแอนติเซนส์ ไพรเมอร์สำหรับ PCR และยารักษาอื่นๆ ที่อิงจากกรดนิวคลีอิก ซึ่งต้องการการควบคุมลำดับและความบริสุทธิ์อย่างแม่นยำ