สารนี้ถูกใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์ oligonucleotides โดยเฉพาะในการผลิตลำดับ DNA และ RNA ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้างหลักในกระบวนการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง (solid-phase synthesis) ซึ่งช่วยในการเพิ่มนิวคลีโอไทด์ cytidine อย่างแม่นยำลงในสาย oligonucleotide ที่กำลังเติบโต กลุ่มปกป้อง เช่น tert-butyldimethylsilyl (TBDMS) ที่ 2'-O และ dimethoxytrityl (DMT) ที่ 5'-O ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกเฉพาะและป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ส่วนของ phosphoramidite ช่วยในการจับคู่ที่มีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นสารเคมีสำคัญในการพัฒนา oligonucleotides สำหรับการบำบัด โปรบวิจัย และเครื่องมือวินิจฉัย ใช้ทั่วไปในสาขาชีววิทยาโมเลกุล การวิจัยพันธุกรรม และการพัฒนายาเพื่อสร้างลำดับกรดนิวคลีอิกที่กำหนดเอง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในเทคโนโลยีชีวภาพ เช่น การบำบัดด้วยยีนและ siRNA สำหรับยับยั้งการแสดงออกของยีนเฉพาะ