5-TFA-ap-dU phosphoramidite ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ oligonucleotides โดยเฉพาะในสาขาการวิจัยกรดนิวคลีอิกและการวินิจฉัยโรค มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการเตรียมสาย DNA ที่ถูกดัดแปลง ซึ่งช่วยให้สามารถนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะหรือฉลากเข้าไปในลำดับ oligonucleotide ได้ สารเคมีนี้มีความสำคัญในการพัฒนา probes สำหรับการทดสอบทางพันธุกรรม โดยช่วยในการตรวจจับการกลายพันธุ์หรือลำดับเฉพาะด้วยความแม่นยำสูง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสร้าง oligonucleotides สำหรับการบำบัด เช่น โมเลกุล antisense และ siRNA ซึ่งใช้ในการยับยั้งยีนและการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย บทบาทของมันในการสังเคราะห์ oligonucleotides บนเฟสของแข็งช่วยให้การประกอบลำดับ DNA แบบกำหนดเองมีประสิทธิภาพและแม่นยำ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในทั้งการวิจัยทางวิชาการและการประยุกต์ใช้ทางเทคโนโลยีชีวภาพ