ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยเฉพาะการสังเคราะห์ดีเอ็นเอแบบเฟสแข็ง (solid-phase DNA synthesis) ในเครื่องสังเคราะห์อัตโนมัติ ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยฟอสฟอรัมไมไดต์สำหรับการนำฐานนิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลง โดยเฉพาะ 5-ethynyluracil เข้าสู่อณูกรดนิวคลีอิก

ช่วยให้สามารถนำกลุ่มป้องกันเฉพาะ เช่น กลุ่ม Bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy (DMTr) ที่ตำแหน่ง 5' ซึ่งถอดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน และกลุ่มฟอสฟอรัมไมไดต์ที่ตำแหน่ง 3' เข้ามาเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการจับคู่และความเลือกในการสังเคราะห์อัตโนมัติ ทำให้เกิดการประกอบโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่มีผลผลิตสูง

นิยมใช้ในการผลิตโอลิโกนิวคลีโอไทด์สำหรับงานวิจัยทางพันธุกรรม การตรวจวินิจฉัยโรค การพัฒนายาแบบเฉพาะบุคคล และเทคนิคต่างๆ เช่น PCR การถอดรหัสลำดับดีเอ็นเอ และไมโครแอเรย์ การดัดแปลงด้วยกลุ่ม 5-ethynyl ช่วยให้สามารถทำการปรับแต่งเพิ่มเติมหลังสังเคราะห์ เช่น ผ่านเคมีคลิก (click chemistry) สำหรับการติดฉลากและการเชื่อมต่อทางชีวภาพ