5-Iodo-2'-O-methyluridine ใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลและชีวเคมี โดยทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลงในการศึกษากโครงสร้างและการทำงานของ RNA จะถูกนำเข้าไปในโมเลกุล RNA เพื่อตรวจสอบผลกระทบของการเมทิลเลชันและการไอโอดีนต่อความเสถียร การพับตัว และการโต้ตอบกับโปรตีนของ RNA นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายา RNA-based ที่มีคุณสมบัติบำบัด โดยเฉพาะในเทคโนโลยี antisense และ siRNA ซึ่งการดัดแปลงช่วยเพิ่มความต้านทานต่อนิวคลีเอสและปรับปรุงความสัมพันธ์ในการจับคู่ คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้มีคุณค่าต่อการถ่ายภาพรังสี X แบบผลึก (X-ray crystallography) สำหรับการกำหนดโครงสร้าง RNA เนื่องจากอะตอมไอโอดีนที่หนักซึ่งช่วยในการ phasing