2'-C-ethynyluridine ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยยาต้านไวรัสและการพัฒนายา โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นอนุภาคนิวคลีโอไซด์อนุโลม ซึ่งสามารถยับยั้งการจำลองตัวของไวรัสบางชนิดโดยการรวมตัวเข้าไปใน RNA ของไวรัสและรบกวนกระบวนการจำลองตัวของไวรัส สารประกอบนี้แสดงศักยภาพในการศึกษาวัยรัส RNA รวมถึงไวรัสตับอักเสบซี (HCV) และเชื้อก่อโรคที่เกี่ยวข้องอื่นๆ นักวิจัยกำลังสำรวจประสิทธิภาพของมันในการพัฒนาการบำบัดยาต้านไวรัสที่มุ่งเป้าไปยังโพลิเมอเรสของไวรัส เพื่อป้องกันไม่ให้ไวรัสเพิ่มจำนวนภายในโฮสต์ นอกจากนี้ กลุ่มเอทิลนิลของมันยังให้จุดยึดที่ทำปฏิกิริยาเพื่อการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์ตัวแทนยาต้านไวรัสที่ซับซ้อนมากขึ้นหรือโปรบสำหรับศึกษากลไกของไวรัส