AMP-PCP disodium ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะอนุภาคที่ไม่สามารถไฮโดรไลซ์ได้ของ ATP โดยทำหน้าที่เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการศึกษากระบวนการที่ขึ้นกับ ATP เช่น กลไกของเอนไซม์และปฏิกิริยาระหว่างโปรตีน โดยเลียนแบบ ATP โดยไม่ถูกเมแทบอลิซึม สารประกอบนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการคริสตัลโลกราฟีเพื่อรักษาโครงสร้างโปรตีนในสถานะที่ผูกติดกับ ATP ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับไซต์การจับโมเลกุลและการเปลี่ยนแปลงโครงสร้าง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการทดสอบการจับแบบแข่งขันเพื่อตรวจสอบความจำเพาะและความสัมพันธ์ของโปรตีนที่จับ ATP ช่วยในการพัฒนายับยั้งที่กำหนดเป้าหมายสำหรับการประยุกต์ใช้ทางการบำบัด ความเสถียรและความต้านทานต่อการไฮโดรไลซ์ทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับการทดลองที่ต้องการการควบคุมที่แม่นยำเหนือปฏิกิริยาที่คล้ายกับ ATP