สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์ oligonucleotide ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในด้านชีววิทยาโมเลกุลและเทคโนโลยีชีวภาพ โดยเฉพาะในการสร้างดีเอ็นเอสายเดี่ยวหรือสายคู่สำหรับการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ การพัฒนายา และการวินิจฉัยโรค กลุ่ม Dimethoxytrityl (DMT) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่ไฮดรอกซิลที่ตำแหน่ง 5' ของน้ำตาลดีออกซีไรโบส ซึ่งช่วยควบคุมการเติบโตของสาย oligonucleotide อย่างมีประสิทธิภาพในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาด้านพันธุศาสตร์และชีวเคมี เพื่อทำความเข้าใจกลไกการทำงานของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอในเซลล์