5-BrUTP sodium salt ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลและชีวเคมีในการศึกษาเกี่ยวกับการสังเคราะห์ RNA และการเผาผลาญ RNA มันทำหน้าที่เป็นอนุโลมของยูริดีนที่สามารถถูกนำเข้าไปใน RNA ระหว่างกระบวนการถอดรหัส (transcription) ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารถติดตามและแสดงภาพโมเลกุล RNA ได้ คุณสมบัตินี้ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าต่อในเทคนิคต่างๆ เช่น การติดฉลาก RNA (RNA labeling), การทดลองพัลส์-เชส (pulse-chase experiments), และฟลูออเรสเซนซ์ อิน ซิทู ไฮบริดิเซชัน (FISH) เพื่อศึกษาพลวัตและการกระจายที่ตั้งของ RNA ในเซลล์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาการทดสอบเพื่อตรวจสอบกิจกรรมของ RNA polymerase และสำรวจกลไกของการถอดรหัส การนำเข้าไปใน RNA ยังช่วยในการศึกษา การแปรสภาพ RNA (processing), การย่อยสลาย (degradation), และการโต้ตอบกับโปรตีน ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการแสดงออกของยีนและหน้าที่ของเซลล์