DNase ใช้ในการแพทย์เพื่อช่วยลดความหนืดของเสมหะในผู้ป่วยที่มีภาวะเสมหะเหนียวข้น เช่น ผู้ป่วยโรคซิสติกไฟโบรซิส โดยการย่อยสลาย DNA ที่อยู่ในเสมหะ ทำให้ผู้ป่วยสามารถขับเสมหะออกได้ง่ายขึ้น ช่วยปรับปรุงการทำงานของปอดและลดการติดเชื้อทางเดินหายใจ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการทางชีววิทยาสำหรับการกำจัด DNA ในกระบวนการทำให้โปรตีนบริสุทธิ์ โดยการย่อยสลาย DNA ที่ปนเปื้อน นอกจากนั้น ยังช่วยในการดูแลบาดแผลโดยการกำจัด DNA นอกเซลล์จากแผลเรื้อรัง ส่งเสริมการหายที่รวดเร็วขึ้น