เอนโดนิวคลีเอส BcII เป็นเอนไซม์ที่ใช้ในการตัดสาย DNA เฉพาะที่ลำดับเบสที่กำหนด งานหลักของเอนไซม์นี้คือการช่วยในการวิเคราะห์และจัดการ DNA ในห้องปฏิบัติการ ตัวอย่างการใช้งาน ได้แก่ การตัด DNA เพื่อสร้างชิ้นส่วนที่ต้องการสำหรับการโคลนนิ่ง การวิเคราะห์ลำดับเบส และการสร้างแผนที่จำแนก DNA นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคทางชีวโมเลกุลต่างๆ ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารถศึกษาและปรับเปลี่ยนข้อมูลทางพันธุกรรมได้อย่างแม่นยำ