ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการผลิตยาหรือสารชีวภาพ เนื่องจากหมู่ฟลูออรีนและไนโตรช่วยปรับคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ของโมเลกุล ทำให้มีความเหมาะสมในการพัฒนายาที่ต้องการความสามารถในการจับกับเป้าหมายเฉพาะ เช่น เอนไซม์หรือตัวรับในเซลล์ นอกจากนี้ หมู่ซัลโฟนิลฟลูออไรด์สามารถทำปฏิกิริยากับหมู่อะมิโนหรือไฮดรอกซิลได้ดี จึงเหมาะสำหรับการสร้างพันธะโควาเลนต์ในโปรตีนหรือสารชีวโมเลกุลอื่น ๆ ใช้ในงานวิจัยด้านโปรตีโอมิกส์หรือการติดตามการทำงานของโปรตีนในระบบชีวภาพ