สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลไธโอมีความตอบสนองสูง ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างยาและสารเคมีเกษตร สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์ส่วนประกอบที่ใช้งานได้ในยาที่เล็งเป้าหมายโรคต่าง ๆ รวมถึงยาต้านการอักเสบและยาต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตสารเคมีเฉพาะทางที่ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ เช่น พอลิเมอร์และสารเคลือบผิว ความหลากหลายและการตอบสนองของมันทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม