N'-Nitro-L-arginine methyl ester hydrochloride ใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกของไนตริกออกไซด์ (NO) ในระบบชีวภาพ โดยเฉพาะในด้านสรีรวิทยาและเภสัชวิทยา มันทำหน้าที่เป็นสารยับยั้งเอนไซม์ nitric oxide synthase (NOS) ซึ่งช่วยลดการผลิตไนตริกออกไซด์ ทำให้สามารถศึกษาผลกระทบของไนตริกออกไซด์ต่อระบบหัวใจและหลอดเลือด ระบบประสาท และกระบวนการอักเสบได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการทดลองเพื่อเข้าใจบทบาทของไนตริกออกไซด์ในโรคต่าง ๆ เช่น ความดันโลหิตสูง โรคหลอดเลือด และโรคทางระบบประสาท