สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในสาขาเคมีเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ตัวยาเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มอะมิโนและวงแหวนอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยเมทอกซี่ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา มันมักถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะอย่างยิ่งยาที่มุ่งปรับกิจกรรมของสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ส่วนของไซโคลเฮกซานอลยังช่วยในการสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติสเตอริโอเคมีเฉพาะ ซึ่งสำคัญต่อประสิทธิภาพและความเลือกสรรของยา นักวิจัยยังสำรวจศักยภาพของมันในการออกแบบสารประกอบที่มีคุณสมบัติแก้ปวดหรือต้านอาการซึมเศร้า โดยใช้กรอบเคมีที่เป็นเอกลักษณ์สำหรับกิจกรรมทางชีวภาพที่มุ่งเป้า